Genetisch polymorfisme in BIN1 in plaats van APOE wordt geassocieerd met een slecht herkenningsgeheugen bij mannen zonder dementie

Studiecohort

De huidige studie analyseerde gegevens en bloedmonsters die waren verzameld van mannen die waren gerekruteerd als onderdeel van de Geelong Osteoporose Study (GOS), een lopend prospectief bevolkingsonderzoek. Kortom, naar leeftijd gestratificeerde steekproeven van mannen en vrouwen werden willekeurig gekozen uit de kiezerslijsten voor de Barwon Statistical Division in het zuidoosten van Australië12. Een totaal van 1.540 mannen werden gerekruteerd bij de baseline van 2001 tot 2006 (deelname van 67%), gevolgd door herbeoordelingsfasen van 5, 6 en 15 jaar. Deze studie omvat een transversale analyse van gegevens en bloedmonsters die zijn verzameld van 449 mannen tijdens de 15-jarige follow-upfase (2016-2020). De deelnemers waren meestal blank (~ 98%). Ze gaven informatie over hun levensstijl en demografische kenmerken, naast het ondergaan van mentale en fysieke gezondheidsbeoordelingen. Opnamecriteria waren een vermelding op de kiezerslijsten voor de Barwon Statistical Division en verblijf in het gebied voor minimaal 6 maanden. Alle deelnemers gaven schriftelijke geïnformeerde toestemming om deel te nemen aan het onderzoek, dat werd goedgekeurd door de Human Research Ethics Committee van Barwon Health. Alle uitgevoerde procedures waren in overeenstemming met de ethische normen van de institutionele en nationale onderzoekscommissies en met de Helsinki-verklaring van 1964 en de latere wijzigingen of vergelijkbare ethische normen.

Beoordelingsprocedures en monsterverzameling

De cognitieve functie werd geëvalueerd met behulp van een computergebaseerde neuropsychologische batterij, de CogState Brief Battery (CBB), die eerder is beschreven13,14,15. De CBB vereist dat deelnemers reageren op stimuli-kaarten als onderdeel van een detectie (DET), identificatie (IDN), één-kaart leren (OCL) en één-achter (OBK) taak die de cognitieve prestaties beoordeelde op vier domeinen, namelijk de psychomotorische functie , respectievelijk visuele identificatie/aandacht, herkenningsgeheugen/leer- en werkgeheugen. Voor elke taak waren zowel een oefenproef als een echte test opgenomen. De taken werden uitgevoerd door deelnemers in een stille kamer onder begeleiding van een onderzoeker. Voor de taken DET, IDN en OBK werden scores berekend door de tijd (milliseconden) te meten die nodig was om correct te antwoorden, die vervolgens werd genormaliseerd met behulp van een log10 transformatie. Voor de OCL-taak werden scores berekend op basis van de nauwkeurigheid van de respons van de deelnemer en genormaliseerd met behulp van een arcsinus-vierkantsworteltransformatie. Verder werden scores voor de algehele cognitieve functie (OCF) bepaald door de primaire metingen in de vier domeinen te combineren. Voor de taken DET, IDN en OBK duidden lagere scores dus op betere cognitieve prestaties en voor OCL en OCF duidden hogere scores op betere prestaties. De individuele scores op de vier taken en samengestelde scores werden gebruikt in de huidige analyse. Bovendien ondergingen de deelnemers het Mini-Mental State Examination (MMSE), dat hun algehele cognitieve functie beoordeelde16.

andere maatregelen

Details over sociodemografische variabelen zoals opleiding, roken en burgerlijke staat werden verkregen uit zelfrapportages. Onderwijs werd gedefinieerd als een nominale factor op basis van voltooiing van het secundair onderwijs. Evenzo werd burgerlijke staat (samenwonen met een partner) gedefinieerd als samenwonen met een partner (gecodeerd „1“) of niet (gecodeerd met „0“). Deelnemers die aangaven minstens één sigaret per dag te roken, werden gedefinieerd als huidige rokers. Het gestructureerde klinische interview voor Diagnostische en statistische handleiding voor psychische stoornissen, vierde editie, Non-Patient Edition (SCID-I/NP) werd gebruikt om een ​​levenslange geschiedenis van stemmingsstoornissen te bepalen, zoals eerder beschreven17.

DNA-extractie en genotypering

Bloed verzameld van deelnemers na een nacht vasten werd gescheiden in verschillende hoeveelheden serum, plasma en buffy coats en bewaard bij -80 ° C tot gebruik. Totaal genomisch DNA werd geïsoleerd uit buffy coats met behulp van QIAamp® DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden, Duitsland) volgens de instructies van de fabrikant. De DNA-monsters werden gegenotypeerd voor de SNP’s rs429358 (APOE ε4), rs7412 (APOE ε2) en rs744373 (BIN1) bij de Australian Genome Research Facility, Brisbane met behulp van het Agena Bioscience MassARRAY®-platform. De dragerstatus werd bepaald door de aanwezigheid van ten minste één kopie van het risico-allel. Daarom werden in de huidige studie naar GG / GA- en AA-genotypen verwezen als: BIN1 G+ en BIN1 G−, respectievelijk. evenzo, APOE ε4+ verwees naar de aanwezigheid van ten minste één ε4-allel. De allelverdeling voor beide BIN1 en APOE niet afwijken van het Hardy-Weinberg-evenwicht.

Statistische analyses

Kenmerken werden vergeleken over BIN1 G+ en BIN1 G−, en APOE ε4+ en APOE ε4- deelnemers die Student’s t-tests gebruiken voor continue variabelen en chi-kwadraattests voor categorische variabelen. Eenvoudige lineaire regressieanalyses werden uitgevoerd om de associatie tussen BIN1 dragerschap en cognitieve functie. De uitkomst, cognitieve functie, omvatte scores op elk van de vier taken en OCF. Verder zijn multivariabele lineaire regressiemodellen aangepast voor leeftijd en APOE dragerschap werden ontwikkeld voor elke uitkomst. Evenzo werden ongecorrigeerde en voor leeftijd gecorrigeerde lineaire regressieanalyses uitgevoerd met APOE status als blootstellingsvariabele en cognitieve functie als uitkomst. Hierna volgen interacties tussen BIN1 en APOE risico-allelen werden onderzocht met behulp van niet-aangepaste en voor leeftijd gecorrigeerde regressiemodellen voor alle vijf uitkomsten. Ten slotte is de associatie tussen BIN1 dragerschap en cognitieve functie werden vergeleken tussen APOE ε4 dragers en niet-dragers om te onderzoeken of het effect van BIN1 verschilt tussen de twee groepen. Benjamini-Hochberg-correctie werd toegepast om te corrigeren voor het percentage valse ontdekkingen als gevolg van meerdere tests18. Alle statistische analyses zijn uitgevoerd met Stata/SE 17.0 en Python 3.8.5.

Kommentar verfassen

Deine E-Mail-Adresse wird nicht veröffentlicht. Erforderliche Felder sind mit * markiert