Studie identificeert nieuw gen dat darmkanker veroorzaakt

Studie identificeert nieuw gen dat darmkanker veroorzaakt

Recidiverend ontregelde superversterkers bij CRC-patiënten. a Studie overzicht. Figuur aangepast van SMART Servier Medical Art, gereproduceerd met toestemming, gelicentieerd onder een Creative Commons Attribution 3.0 unported-licentie. b PCA van H3K27ac-signaal bij 2026 SE’s in CRC (n= 15 onafhankelijke weefselmonsters), normaal slijmvlies (n = 15), crypten(n = 4) en FAP-adenomen (n= 2). c, d GSEA tussen SE proximale genen en differentieel tot expressie gebrachte genen tussen CRC en normaal. e H3K27ac ChIP-seq baan dichtbij ASCL2 . Twee proximale SE’s zijn onderstreept. De y-assen van alle ChIP-seq-tracks zijn hetzelfde geschaald. f 2026 SE’s per log2 vouwverandering in H3K27ac-signaal met 12 kandidaat-SE-doelgenen op basis van overlap van rangorde en recidief geannoteerd. g Heatmap van H3K27ac-signaal bij 583 differentieel tot expressie gebrachte SE’s (P< 0,01, tweezijdig Student's ttesten). Brongegevens worden geleverd als een brongegevensbestand. NES genormaliseerde verrijkingsscore, FDR false discovery rate. Credit: Natuurcommunicatie(2022). DOI: 10.1038/s41467-022-33377-8

Onderzoekers van het Tisch Cancer Institute van Mount Sinai hebben een nieuw gen geïdentificeerd dat essentieel is voor de groei van darmkanker en ontdekten dat ontstekingen in de externe omgeving rond de tumor kunnen bijdragen aan de groei van tumorcellen. De wetenschappers rapporteerden deze bevindingen in Natuurcommunicatie.

Dit is de eerste keer dat wetenschappers hebben ontdekt dat de omgeving rond een darmkankertumor kan programmeren wat bekend staat als een „superversterker“, een complex DNA-gebied met een hoge concentratie aan transcriptionele machines die controleert of een cel kwaadaardig is .

Deze superversterker – de grootste 1-2% van alle versterkers in de cel – reguleert het gen PDZK1IP1, dat voorheen niet werd geïdentificeerd als een kankergen. Nadat onderzoekers PDZK1IP1 hadden verwijderd, vertraagde de groei van darmkanker, wat suggereert dat PDZK1IP1 en zijn superversterker doelen zouden kunnen zijn voor antikankertherapieën.

„In de Verenigde Staten is darmkanker de op twee na meest voorkomende en op één na dodelijkste kanker“, zegt de eerste auteur van de studie, Royce Zhou, een MD/Ph.D. student aan de Icahn School of Medicine op de berg Sinaï. „Deze kanker is afhankelijk van chirurgie voor behandeling, en immunotherapieën die een revolutie teweeg hebben gebracht in de behandeling van geavanceerde kanker hebben alleen gewerkt voor een kleine subgroep van patiënten met darmkanker. Daarom is er een grote behoefte aan nieuwe doelidentificatie.“






Krediet: het Mount Sinai-ziekenhuis

Uit deze studie bleek dat de superversterker wordt geactiveerd door omringende ontstekingen in de micro-omgeving van de tumor. Door de ontsteking kunnen de kankercellen overleven in een omgeving die ze anders niet zouden hebben. Inflammatoire darmziekte is een bekend risico op darmkanker; deze bevinding zou kunnen bijdragen aan het begrip van het betrokken mechanisme.

„Wat dit voor de meeste patiënten met darmkanker betekent, is dat een ontsteking die in de tumor optreedt, bijdraagt ​​aan de groei van de tumor. Dit benadrukt het belang van het begrijpen wat we kunnen doen om de ontstekingseffecten in de dikke darm te beteugelen door preventie of door te begrijpen welke voedingseffecten zou kunnen hebben op de micro-omgeving in de dikke darm“, zegt senior auteur Ramon Parsons, MD, Ph.D., directeur van het Tisch Cancer Institute aan de Icahn School of Medicine op de berg Sinaï. „Wat de behandeling betreft, hebben we genetisch bewijs dat het richten op dit gen tumoren daadwerkelijk remt. Door al deze verschillende componenten te begrijpen, zullen we betere hulpmiddelen hebben om te proberen de ziekte te voorkomen.“

Deze ontdekking werd mogelijk gemaakt door direct na de operaties van 15 darmkankerpatiënten levend tumorweefsel en omringend gezond weefsel te bestuderen. Door levende cellen te kunnen voorbereiden en analyseren, konden onderzoekers de micro-omgeving van de tumor en de genetische en biologische oorzaken van darmkanker zien, zei dhr. zei Zhou.

„We hadden levende specimens van levende cellen, rechtstreeks uit de operatiekamer, waardoor we de epigenetische toestand van die tumor onmiddellijk konden meten“, zegt Dr. Parsons toegevoegd. „Zonder die infrastructuur hier op de berg Sinaï hadden we deze ontdekking niet kunnen doen.“


Wat is een ontlastings-DNA-test?


Meer informatie:
Royce W. Zhou et al, Een lokale tumormicro-omgeving verworven super-enhancer induceert een oncogene driver in colorectaal carcinoom, Natuurcommunicatie(2022). DOI: 10.1038/s41467-022-33377-8

Geleverd door The Mount Sinai Hospital

Citaat: Studie identificeert nieuw gen dat darmkanker veroorzaakt (2022, 17 oktober) opgehaald op 23 oktober 2022 van https://medicalxpress.com/news/2022-10-gene-colon-cancer.html

Op dit document rust copyright. Afgezien van een eerlijke handel ten behoeve van eigen studie of onderzoek, mag niets worden gereproduceerd zonder schriftelijke toestemming. De inhoud wordt uitsluitend ter informatie verstrekt.

Kommentar verfassen

Deine E-Mail-Adresse wird nicht veröffentlicht. Erforderliche Felder sind mit * markiert