UVA sluit zich aan bij Amerikaans netwerk dat zich voorbereidt op infectie

Madhav Marathe, PhD

afbeelding: Madhav Marathe, PhD, is directeur van de Network Systems Science and Advanced Computing Division van het UVA Biocomplexity Institute.
visie meer

Krediet: Universiteit van Virginia

Onderzoekers van de University of Virginia School of Medicine en het UVA Biocomplexity Institute zijn geselecteerd om te helpen bij het opzetten van een nationaal bewakingsnetwerk voor pathogene genomica dat werkt om toekomstige uitbraken en pandemieën van infectieziekten beter te identificeren, erop te reageren en te voorkomen.

Samen met de Virginia Division of Consolidated Laboratory Services, Virginia Department of Health en Virginia Commonwealth University, richten de UVA-onderzoekers een centrum op in Virginia in het nationale Pathogen Genomics Centers of Excellence Network. Het centrum in Virginia is een van de slechts vijf in het land dat is gekozen door de Amerikaanse Centers for Disease Control and Prevention.

Een sleutel tot het ontwikkelen van tests, behandelingen en vaccins voor COVID-19 – en het voorspellen van de verspreiding van het virus – was het begrijpen van de genetische samenstelling van het virus door middel van sequencing van het hele genoom. Het doel van dit genomics-netwerk: gebruik maken van gegevens over genomische pathogenen om de respons op toekomstige en huidige infectieziekten te stimuleren.

„Het combineren van pathogene genomica met epidemiologische gegevens kan transmissieroutes onthullen om ons te helpen een pathogeen beter te begrijpen. Hoe eerder je die kennis hebt, hoe eerder je manieren kunt ontwikkelen om de verspreiding ervan te vertragen of te stoppen‘, zegt Amy Mathers, MD, specialist in infectieziekten bij UVA Health en leider van het initiatief bij UVA. „Je kunt ook diagnostiek ontwikkelen om het te identificeren en erop te testen.“

Voortbouwen op ervaringen van COVID-19

Zowel UVA Health als het UVA Biocomplexity Institute zijn goed gepositioneerd om nieuwe manieren te ontdekken om beter te reageren op uitbraken van infectieziekten. Een laboratoriumteam onder leiding van Mathers en Mindy Poulter, PhD, hielp UVA Health om het eerste ziekenhuis in Virginia te worden dat de COVID-19-tests doorstond in de eerste weken van de pandemie, en Mathers leidde ook een onderzoek waarin werd bevestigd dat het testen van afvalwater een effectieve methode is voor COVID-19 volgen.

Het COVID-19-responsteam van het Biocomplexity Institute overlegt ondertussen met de CDC, het ministerie van Defensie en het Gemenebest van Virginia over de COVID-19-pandemie sinds begin 2020, inclusief het opstellen van een wekelijks rapport voor het Virginia Department of Health met ziekteprojecties en analyseert.

Het team van Mathers zal zich richten op het groeiende probleem van antibioticaresistentie en ’superbacteriën‘ die niet reageren op bestaande antibiotica, evenals op de verdere verfijning van afvalwatertoezicht om antibioticaresistentie en andere infectieziekten op te sporen. Die gegevens en informatie zullen op hun beurt worden gedeeld met onderzoekers van het Biocomplexity Institute om hen te helpen bij het ontwikkelen van nauwkeurigere modellen en analyses van zowel toekomstige uitbraken van infectieziekten als de effecten van antibioticaresistentie.

“Afvalwaterbewaking is tijdens de COVID-19-pandemie al gebleken als uiterst nuttige maatstaf voor het meten van de ziekte en het begeleiden van de reactie op uitbraken. Dat gezegd hebbende, dit is nog steeds een nieuwe bewakingstechniek, en er is veel onderzoek nodig om dit aan te scherpen tot een volledig operationeel en routinematig hulpmiddel in ons arsenaal”, zegt Madhav Marathe, PhD, directeur van de Network Systems Science and Advanced Computing. Divisie bij het Biocomplexity Institute. „Bovendien belooft afvalwatertoezicht een groot aantal andere nuttige informatie voor volksgezondheidsfunctionarissen, en we zijn verheugd om met hen samen te werken om die gegevens in de praktijk te helpen vertalen.“

Het team van het Biocomplexity Institute zal ook breder werken om bruikbare informatie over infectieziekten te delen via een nationaal platform genaamd Scalable Cyberinfrastructure for Genomic Surveillance (SCIGS), en training geven over hoe het platform en zijn schat aan informatie het best kunnen worden gebruikt.

„Het doel is om het delen en analyseren van biosurveillancegegevens voor CDC en andere lokale volksgezondheidsinstanties mogelijk te maken om te gebruiken bij hun crisisreacties en de reguliere dagelijkse volksgezondheidspraktijken“, zegt Bryan Lewis, PhD, MPH, een computationeel epidemioloog bij het Biocomplexity Institute.


Vrijwaring: AAAS en EurekAlert! zijn niet verantwoordelijk voor de juistheid van persberichten die op EurekAlert! door bijdragende instellingen of voor het gebruik van informatie via het EurekAlert-systeem.

Kommentar verfassen

Deine E-Mail-Adresse wird nicht veröffentlicht. Erforderliche Felder sind mit * markiert